早前任天堂向GBA4iOS的開發者發通知，要求GBA4iOS官網把侵權的模擬器下架。通知發出後開發者即時對有關模擬器下架，不過近日開發者Riley Testut表示，全新版本的GBA4iOS重新上架了，為了符合任天堂版權的問題，Riley進行了一系列的修改，並把新版本2.0.4全新放到他們的官網，讓人進行下載。
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Riley把GBA4iOS的網際瀏覽器首頁，由CoolROM下載網頁改為Google的主頁。同時把GBA4iOS內，控制器Skin上的GBA Logo移除，同時亦修復了不少的BUG，讓GBA4iOS運時時可以更穩定。開發者表示，他們正開發2.1版本的更新，除了新增一些新功能外，還會對模擬器的設計進行一些的改善。
