每一代 iPhone 推出的時候，總會伴隨一些微小也影響深遠的問題發生，iPhone 4 有「天線門」、iPhone 6 有「拗曲門」，而 iPhone 6s 發售了沒多久，終於發現了明顯的問題。
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有 Reddit 用戶發表文章投訴，指自己的相機在室溫環境使用 iPhone 6s，卻發現 6s 是 iPhone 各世代之中最熱的，他量度手機的溫度，竟然高達華氏 88 度。不少用戶也遇上同樣的問題，就是使用 iPhone 6s 的時候，機體溫度（以華氏計算）高達 102 度，比 iPhone 6 以前的 90 度為高，最令人憂慮的是，他們沒有打開其他，甚至連最浪費電力的 Facebook 都清除了，結果都是一樣。
結果手機出現了一個十分嚴重的問題，就是相機 App 出現警告，無法使用閃光燈之餘，顯示 iPhone 而需要冷卻才能重新使用。他們需要打開飛行模式，令手機冷卻，閃光燈才能回復正常。
目前我們暫時未知成因，亦未知問題是否普遍，但手機過熱不是第一日發生，之前高通推出的 Snapdragon 810 處理器都有類似的問題，過熱的手機可能導致元件嚴重損壞。面對這個情況，現在暫時只能以軟件更新修正問題，且看看蘋果如何以 iOS 9.0.X 或 iOS 9.1 更新修正部分問題，以軟件和系統的層面讓手機冷下來了。
